Skuhra bol šéfom tajných služieb v období, keď kreslo ministra obrany zastával Martin Glváč. S Kočnerom mal v tomto čase tiež kamarátsky vzťah.
A práve Ľubomír Skuhra podporil Martina Glváča v prípade dopisovania si s Alenou Zsuzsovou, ktorá je tiež obzalovaná z vraždy Jána Kuciaka. Glvac tvrdil, že písanie si so Zsuszovou bolo pod kontrolou vojenského spravodajstva, ktorému velil Skuhra, najnovšie ďalší dopisovací kamarát Kočnera.
Glváč: Skuhra má moju dôveru
Minister obrany Martin Glváč (2012–2016) vymenoval v roku 2012 Skuhru za šéfa Vojenského obranného spravodajstva. VOS pôsobila ako domáca kontrarozviedka. Vtedy ešte samostatná Vojenská spravodajská služba bola zahraničná rozviedka, no za Glváča chystali spojiť obe organizácie do jednej.
„Železné dvere medzi ministerstvom a VOS sa znovu otvorili. Pán Skuhra má moju dôveru a spolu s riaditeľom Vojenskej spravodajskej služby pánom Tibenským budú kľúčovými osobami pri zlučovaní oboch služieb,“ povedal Glváč po vymenovaní Skuhru v roku 2012.
Po spojení oboch služieb sa riaditeľom nového Vojenského spravodajstva stal práve Skuhra. Vo funkcii skončil v roku 2016, keď sa ministrom stal Peter Gajdoš (SNS). Ministerstvo obrany potvrdilo, že Skuhra už ani ako civil nepôsobí na ministerstve obrany.
Pomohol Kočner zastaviť stíhanie Skuhru?
Skuhra sa vrátil do vedenia vojenských agentov po vláde Ivety Radičovej (2010–2012). VOS totiž viedol aj počas prvej vlády Roberta Fica (2006–2010). Práve počas Radičovej vlády nominanti novej exekutívy objavili podozrivé prevody bytov a nehnuteľností medzi oboma vojenskými tajnými službami. Následne sa byty prevádzali na spriaznené firmy alebo predávali za zlomkové ceny.
Polícia podozrenia aj voči Skuhrovi síce vyšetrovala, no v roku 2015 stíhanie zastavila s tým, že „skutok sa nestal“. Prezidentom policajného zboru bol vtedy Tibor Gašpar, na ktorého mal podľa uniknutej komunikácie z aplikácia Threema výrazný vplyv Norbert Bödör, cez ktorého vybavoval na polícii všetky záležitosti práve Marián Kočner, s ktorým bol Skuhra najnovšie vo veľmi čulom až priateľskom kontakte.